章节目录 第466章 合作论文(2 / 2)

作品:《学习暴富后,我孤立了整个豪门》

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“看来什么都不容易,我还是乖乖去找老师帮我申请吧。”

房子,电路改造,散热系统,网络专线,安保措施。

每一样都是时间和精力的无底洞。

她现在连买房子的时间都挤不出来,更别说折腾这些了。

晚上快九点的时候,程竞星的邮箱终于收到沈砚池发来数据。

三套脱敏的蛋白质时序网络数据,两套耐药机制,一套信号通路。

程竞星没有急着全部跑,她先挑了最小的那套信号通路数据做迁移测试。

节点少,边稀疏,跑起来快,适合验证框架的适配性。

她花了半天时间写了一个数据转换脚本。

把蛋白质网络的邻接表映射成代码库要求的拓扑输入格式,边权对应耦合参数,药物浓度作为扰动输入ε。

初八早上,她按下回车。

扫描引擎启动,参数空间开始遍历。

这套信号通路数据只有不到两百个节点,代码库跑得飞快,大约四十分钟后,结果出来了。

程竞星盯着输出的风险地图,目光落在其中三条边上。

这三条边在六个时间点里,边权变化幅度都不大。

传统统计方法会判定它们‘稳定无变化’。

但她的框架显示,在第三到第四个时间点之间。

这三条边的耦合强度已经逼近了结构稳定性边界,临界值从0.08骤降到0.03。

也就是说,只要外部扰动再大一点点。

哪怕只是药物浓度微调5%。

这三条边就会越过边界,整个网络的投影结构就会发生改变。

而传统方法把这种变化当成了噪声。

她打开沈砚池之前发的那张图,对比实验记录。

这三条边对应的蛋白质……恰好是信号通路里的关键调控节点。

如果这三条边的耦合关系真的在微观层面发生了偏移,而传统方法检测不到。

那耐药表型的真实变化路径,可能就藏在这里。

程竞星截了几张图,整理了一份初步的分析报告,发给了沈砚池。

不到十分钟,对方回了一通电话。

“程同学,你这个结果,第三条边对应的那个蛋白,我们去年做敲除实验的时候确实观察到表型变化,但当时归因于上游调控,没往这条边本身想。”

沈砚池的声音里压着兴奋。

“你这个框架给出的时间窗口,跟我们实验里表型翻转的时间点,差了不到六个小时。”

程竞星将手机放到右手边,“这说明迁移方向是对的。接下来我跑两套耐药数据,规模大一些,可能需要一两天。”

“好,你慢慢来,不急。”沈砚池顿了顿,“程同学,我就直说,如果两套耐药数据也能跑出类似的结果,这篇合作论文的分量,可能比我们之前预估的还要重。”

“嗯。”

挂了电话,程竞星打开另一个文件夹。

谢观澜那边的工程数据也到了。

电话同时响起,是谢观澜打来的。

“工程数据的邮件收到了吗?”

“收到了,正在看,这次麻烦你了。”程竞星说。

“不麻烦,也就动动嘴皮子的事,那你先忙。”

“好。”程竞星听到那边传来有人说话的声音,像是在做报告。

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